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微生物平臺(tái)

菌株鑒定

儀器型號(hào)

Hitachi Regulus8100,Sigma 300;Zeiss Gemini 300; Hitachi S4800;JSM-7800F;蔡司 Supra 55等

預(yù)約次數(shù):36871
新客專享:首單立減200元
測(cè)試收費(fèi):溝通
詳細(xì)介紹
 
項(xiàng)目介紹
 
采用測(cè)序方法對(duì)各種細(xì)菌16S rDNA或者真菌的 ITS進(jìn)行了廣泛的研究,獲得了大量的DNA序列信息,保守序列區(qū)域反映了生物物種間的親緣關(guān)系,而高變序列區(qū)域則能體現(xiàn)物種間的差異。將測(cè)序得到的16S rDNA序列在NCBI上進(jìn)行Blas比對(duì),即可獲知與該序列同源性較高的已知序列,為確定菌種的分類學(xué)地位提供依據(jù)。
 
樣本要求
 
菌株:需要提供純化后的菌株,單克隆菌落(平板)或菌液(至少200uL),冰袋寄送
基因組DNA溶液:濃度≥50 ng/μL,總體積≥10μL,且純度達(dá)標(biāo)(OD260/OD280在1.6-1.8之間),干冰寄送
 
結(jié)果展示
 
1. 交付內(nèi)容
測(cè)序原始數(shù)據(jù)、比對(duì)結(jié)果、實(shí)驗(yàn)報(bào)告
2. 測(cè)試周期
7個(gè)工作日左右
3. 結(jié)果展示(部分)
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以上內(nèi)容僅供參考,具體以實(shí)際測(cè)試為準(zhǔn),不同儀器會(huì)有差異,需要了解詳細(xì)的結(jié)果形式,請(qǐng)聯(lián)系e測(cè)試工作人員
 
常見問題
 
question 
1、菌種鑒定可以鑒定到株嗎?
不能鑒定到株,菌種鑒定結(jié)果通過比對(duì)相似度超過99%一般定義為同一種菌
 question
2、PCR擴(kuò)增切膠純化測(cè)序出現(xiàn)套峰是什么情況?
測(cè)序結(jié)果個(gè)別堿基出現(xiàn)N,或者部分連續(xù)出現(xiàn)套峰,是由菌種rDNA多態(tài)性造成,對(duì)菌種鑒定無影響;所有測(cè)序反應(yīng)均出現(xiàn)大面積套峰,由于客戶提供樣品模板不純?cè)斐?,這種情況需要客戶重新純化菌種

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